Una vez que hayas despertado verás un video sobre Chaud y los recientes incidentes en la red, luego hablarás con mamá y verás que te llegará un mail, al leerlo te pedirán que investigues KotoSquare, así que ve enseguida allá. Una vez allá, ve a Gospel HQ y verás que la maldad de Gospel se ha vuelto a instalar, así que ve directamente con papá. Él te explicará lo que resta de Gospel y Kotobuki Town y te dará MagSuit, luego ve a la estación y ve a Kotobuti Town. Una vez allá, verás que el edificio central, o sea, el de Gospel, está lanzando radiación magnética y que se siente, sigue derecho y entra en la máquina y encuentra el cubo que tiene un REGUP3. Luego ve al edifico, entra y llama el elevador, pero verás que alguien va a salir, así que te esconderás y verás que resultaron ser tus amigos, luego pulsa el interruptor y ve al 2° piso. Ahora ve a tu izquierda y entra en el cuarto y en las máquina entra a la red.
En la red, verás que todo está muy raro debido a la radiación; para empezar, ve derecho hasta llegar al cruce, así que ve enfrente y toma el transporte, luego sigue tu camino y toma el Recov150 T del cubo, ahora regresa y toma el otro camino, pero como verás, el transporte está severamente afectado por la radiación, así que te llevará a otra parte. En ese lugar ve primero a la izquierda, sigue el recorrido y llega al cubo que tiene el programa ElBit082, el cual te sirve para componer ciertas cosas en la red. Ahora regresa al transporte y ve por el otro camino y llegarás a un cubo que tiene un HPMEMORY, entonces regresa al transporte y en el mecanismo que se ve activa el ElBit082 y te regresará, luego vuelve al transporte y verás que ya no te manda a la dirección incorrecta, sigue derecho y en el entronque toma el camino de abajo que te manda a otro lugar que no es. Una vez allá sigue derecho y toma el ElBit232, el cual debes usar para llegar a una zona donde tienes dos opciones, toma el camino de la izquierda y llegarás a un REGUP1, regresa al transporte y ve al camino de la derecha que te lleva a la zona siguiente.
Una vez allá, llegarás a un entronque conforme avanzas, sigue derecho y llegarás a un transporte; al tomarlo verás que en ese lugar hay otro cruce, ve hacia abajo y al llegar toma el camino de la derecha para ir a un cubo con 3000 Z, ahora baja y llega a otro cubo que tiene el chip HiCannon*, regresa por el transporte y toma el camino de la derecha, el cual te lleva a un transporte erróneo tras un largo recorrido. En el lugar morado, sigue enfrente, luego toma la izquierda y llega a un cubo con 1200 Z, regresa y toma la derecha que te lleva a otro transporte. Primero, toma el camino que lleva hacia arriba y llegarás a un cubo que tiene el ElBitEV, el cual es el que compone toda la red, pero todavía no llegamos a ese punto, así que ve por el transporte y regresa hasta la zona verde. Toma los dos transportes de vuelta a las zonas anteriores y ve al cruce, ahora ve por el otro camino que lleva a otra zona.
Una vez allá, sigue derecho y toma el transporte a la zona errónea. En ella, sigue al transporte y luego busca otro transporte, que te lleva a otra zona, sigue derecho y del cubo toma el ElBit243, regresa a la entrada de la zona errónea en que te encuentras y te devolverá al transporte, entra de nuevo y te llevará a una zona donde debes llegar a un cruce, toma el camino de la izquierda y sigue hasta encontrar el ElBit253, el cual debes usar en el transporte de la zona errónea en que te encuentras; repite el procedimiento anterior y llegarás a una zona de un cruce inmediato, toma el camino de la izquierda y toma 2000 Z del cubo, luego toma el camino opuesto y llegarás a un transporte afectado.
Una vez en el lugar afectado, ve hacia abajo y llegarás a otro transporte, luego toma el camino de abajo otra vez y llegarás a un transporte que no es erróneo, toma la derecha y encontrarás de nuevo un cruce, toma la derecha y sigue para encontrar el ElBit042, luego toma el camino opuesto y toma los 2000 Z que te tienen. Ahora regresa al transporte afectado del Apart Comp 2 (o sea, de la zona de la que vienes, de la que no encontraste ElBit para el transporte) y busca el transporte malo, usa el ElBit042. Ya que el transporte esté bien, entra en él, después sigue derecho para que en el cubo encuentres el ElBit271, el que sirve en el Apart Comp 3, regresa allá y usa ese ElBit en el 2° transporte afectado; cuando esté bien entra en él, después ve hacia enfrente y encontrarás el ElBit093, regresa al último transporte afectado y úsalo, luego, después de curarlo, entra en él. En la zona que llegarás, verás un cruce, toma la izquierda y sigue hasta el final, donde encontrarás un POWERUP, regresa al camino anterior y llegarás a la zona siguiente.
Estamos en el Apart Comp 4, sigue derecho y toma el transporte luego ve enfrente y en el cruce toma el camino de abajo que lleva a un FullEnrg, luego toma el otro camino y llega al lugar erróneo. En el cruce del lugar, toma la derecha y del cubo obtendrás un BUGFRAG, luego ve por el transporte, sigue tu camino y encontrarás el ElBit201, úsalo en el transporte y al entrar en él llegarás a una zona amarilla, sigue derecho y enfrente verás el mecanismo para volver la red a la normalidad, lo malo es que AirMan, QuickMan y CutMan se opondrán en tu camino, y como no los puedes evitar hay que enfrentar a cada uno de ellos. Ninguno es difícil, ya que son las versiones anteriores, pero no las V3, sino V1; ya cuando hayas matado a los enemigos, usa el ElBitEV en el mecanismo y todo estará normal de nuevo.