Un mod es una "adición" que algunos (sino todos) hacen a todos los juegos, algunos son para mejorar la calidad de video, sonido y demas mientras que otros se centran en la jugabilidad. Tambien tenes mods que agregan misiones, objetos o accesibilidad a cosas que antes no podias. En general es una "mejora" que se hace al juego, muchas veces resulta en mas horas de juego y otras en una divertida alucinacion XD
Seguramente habras visto algun video de algo que se supone en el juego normal no podes hacer por mas que lo intentes millones de veces y de diferentes formas, lo mas probable es que se trate de un "agregado" o mod